愛知医科大学病では、内科、外科を始めとする診療科で、専門医資格の取得を前提とした
専門研修プログラムを設置し、基本19領域の専門医制度に対応しています。
また、専門医取得者はSubspecialtyの学会専門認定を目指すことも可能です。
なお、さらに高い目標設定を行ないたい場合は、従来の大学院に加えて病院で臨床医としての経験を積みながら大学院コースを履修し、
博士の学位を取得する「社会人大学院」も設定しています。
原則的には２年間の臨床研修を修了した卒後３年目から３年間、専修医として専門研修を行います。